Nový způsob genetické analýzy často odhalí abnormality plodu

Genetická analýza pomocí DNA mikročipů poskytuje mnohem lepší výsledky v prenatální screening, než tradiční způsob karyotypizaci.

Tento závěr byl američtí vědci.

Ve velké skupinové studie bylo zjištěno, že DNA microarrays může detekovat klinicky významné abnormality, které nemohly být identifikovány v 6% Karyotyping fetální DNA vzorků se strukturních defektů, a 1,7% vzorků, které byly provedeny v souvislosti s věkem matky a podezřelé výsledky screeningu. To bylo řečeno, Dr. Ronald Uopner z Columbia University Medical Center v prosincovém čísle New England Journal of Medicine.

Tato studie byla jedna ze tří publikovaných prací, že ve srovnání s novou metodu analýzy a karyotypu pro různé diagnostické účely.

Uopner lékař a jeho kolegové uvádějí, že jejich data ukázala DNA microarray výhody jako standardní součást prenatálního screeningu. Tato metoda pomáhá identifikovat další genetické abnormality než zastaralé metody karyotypizací.

Dr. Alexander Radzhkovits, genetik z University of Pittsburgh Medical Center, který nebyl zapojen do těchto studií, řekl v rozhovoru pro on-line vydání "MedPage Dnes&rdquo-, že mnoho amerických lékaři již přešel na nové metody v prenatálním screeningu.

Dr. Radzhkovits poznamenat, že tato metoda, podle jeho názoru, je to historický okamžik ve vývoji genetické analýzy v posledních letech.

DNA microarrays - budoucí prenatální screening

Karyotypu použit pro prenatální diagnostiku genetických chorob od roku 1960. Tato metoda byla pro studium živých buněk pod mikroskopem k detekci abnormalit ve struktuře chromosomů.

DNA mikročipy, na druhou stranu nabízí možnost podrobného studia DNA, včetně identifikace chybějící nebo velmi malé fragmenty. I když karyotyping neumožňuje zvažovat úseky DNA, alespoň 3 milionů párů bází genetických čipy mohou detekovat anomálie ve velikosti fragmentů, několik kilobází.

Ve skutečnosti dnes, DNA mikročipy jsou doporučovány jako diagnostický test v první linii s cílem potvrdit vývojové abnormality a strukturální vady u malých dětí. Ale jen velmi málo klinických studií byly prováděny za účelem zjištění účinnosti této metody v prenatálním screeningu k identifikaci genetických onemocnění u plodu před jeho narozením.

Dr. Uopner a jeho kolegové zahájila rozsáhlou studii. To zahrnovalo 4.406 žen, které byly prenatální genetické testování z různých důvodů, včetně věku matky, nedefinovaný výsledek screeningu Downova syndromu u plodu strukturální abnormality na ultrazvuku.

Každý odebraný vzorek byl rozdělen na dvě části, a testovány metodou Karyotyping metody a DNA mikročipů.

Vědci zjistili, že mikročipy jsou schopni identifikovat všechny aneuploidní a nevyvážené přestavby, které jsou viditelné, když karyotypizací. Ale mikročipy neprokázaly žádné onemocnění, které jsou patrné na větší chromozomální úrovni, včetně vyvážených translokací a triploidů. Nicméně, nová technologie usnadňuje detekci závad na úrovni jednotlivých genů.

U 3,4% vzorků byly zjištěny změny, které mají nejistou klinické hodnotovou z nichž 72,3% jsou nezhoubné, jiní - patogenní. Obavy z nejistým výsledkem screeningu je, že jsou velmi znepokojující pro pacienty, často neopodstatněné.

Dr. Radzhkovits říká matka nejistý výsledek těhotenství je jednou z největších obav a stresory. Tady v této chvíli cítil všechnu důležitost příslušného genetického poradenství jako profesionální interpretuje výsledky zkoušek provedených na dotčených rodičů a dává jim ty správné doporučení.

Pomocí nové metody v stillbirth

Ve druhé studii, Dr. Reddy Uma z Národního ústavu zdraví dítěte a vývoj člověka zjištěno, že testování pomocí DNA mikročipů poskytuje lepší výsledky v genetické diagnostice příčin narození mrtvého dítěte.

Výzkumníci věří, že 6 až 13% mrtvě narozených dětí v důsledku genetických abnormalit plodu, ale četnost těchto anomálií může být vyšší. Mikročipy pomoci identifikovat takové případy, a to nevyžaduje přítomnost živých buněk - velkou výhodu.

Dr. Reddy a její tým studoval vzorky DNA z 532 mrtvě narozených dětí s cílem nalézt genetické abnormality. Bylo zjištěno, že DNA mikročipy jsou mnohem pravděpodobnější, že k získání výsledků, než Karyotyping (87,5% ve srovnání s 70,5%, P<0.001).

Tato metoda se ukázala jako spolehlivá detekce aneuploidie (8,3% proti 5,8%, p = 0,007), což dokazuje účinnost 41,9% (poměr detekční frekvence 1,42- 95% CI 1,07 až 1,89 ). Mikročipy další genetické abnormality detekována ve specifických podskupin, včetně 443 případů prenatální narození mrtvého plodu (8,8% oproti 6,5%, p = 0,02), a v 67 případech s vadami narození mrtvého plodu rozvoje (29,9% vs 19,4%; p = 0,008).

Stejně jako v předchozí studii, mikročipy identifikovat další abnormality s nejistým klinický význam než karyotypizací metodu. Ale vědci k závěru, že to může být dokonce užitečné v některých případech.

Další zpráva strana, výzkumníci zaměřen na genetické onemocnění s názvem poplatek, který nebyl vyřešen buď prenatálně ultrazvukem nebo karyotypizace nebo DNA čipu.

Dr. Cynthia Morton a její kolegové na Harvardu použili úplné genomické sekvenování diagnostikovat toto onemocnění během prenatálního analýzy. V důsledku toho byli schopni určit přesný bod přemístění genetického materiálu. Zjistili, že je na 8q12.2 v CHD7 genu (lokus CHARGE-patogenní syndrom), stejně jako v 6q13 v LMBRD1 genu (locus patogenní recesivní metabolickou poruchou vitaminu B12).

Dr. Kim McBride z Centra pro molekulární genetiky v dětské nemocnici ve městě Columbus (Ohio, USA), není zapojen do studie, řekl, že zpráva obsahuje zajímavou aplikaci nových technologií. Dodal, že byl ohromen tím, že vědci byli schopni získat vzorek DNA, připravit ho plně analyzovat a vypracovat zprávu za pouhé dva týdny. Dr. McBride si není jistý, že tato metoda bude šířena v klinické praxi, ale to je jedinečná v některých případech.

Klady a zápory nového způsobu

Dr. Lorraine Dugoff University of Pennsylvania poznamenal, že nová studie odhalila všechny „energie, složitost a nečekané úskalí spojené s používáním nových technologií v klinické praxi.“

Uvedla, že hlavní nevýhodou nové metody je neschopnost interpretovat klinický význam nových, dosud neznámých variant genetických abnormalit. To znamená, že vědci budou nová výzva - vyvinout obrovskou databázi neznámých genetických abnormalit je spojovat s konkrétními patologií a pochopit, které z nich nemají žádný klinický význam.

Dr. McBride doufá, že jako nové genetické varianty katalogů, počet neznámých dat bude tát rychle.

Ve Spojených státech, analýza pomocí genetických mikročipů k dispozici asi za stejnou cenu jako karyotypizací. Nová analýza je v hodnotě $ 1,500-2,000 v porovnání s $ 1,000-1,500 na karyotypizaci. Nicméně obě metody vyžadují invazivní postupy pro odběr genetického materiálu, který je spojen s malým rizikem potratu.

Studie Dr. Uopnera a Dr. Reddy byla provedena s podporou zdraví dítěte a vývoj člověka Národního institutu (NICHD). Všechny mikroarray a činidla byly poskytnuty Agilent Technologies a Affymetrix.

Sdílet na sociálních sítích:

Podobné